טיפול עקירת שיניים יכול להתבצע בשלוש דרכים:
עקירה ידנית אשר נחשבת לעקירה הפשוטה ביותר, עקירה מורכבת שמבצעים כאשר שורשי השן מפוצלים, ועקירה כירורגית אשר מצריכה חתך בחניכיים. העקירות מתבצעות בהרדמה מקומית. במהלך הטיפול לא יחוש המטופל כאב, בגלל שימוש בחומר אלחוש. עם התפוגגות חומר האלחוש, תיתכן תחושת כאב ברמה כזו או אחרת.
ברוב המקרים, לאחר העקירה, ירגיש המטופל נפיחות ודימום בחלל הפה. סיבוכים אפשריים יכולים להיות זיהומים, פגיעה בסינוסים או במערכת העצבים, היווצרות מכתשית יבשה ועוד.
טיפול איכותי יפחית את הסיכוי ליצירת תופעות לוואי וסיבוכים בלתי רצויים. בכל מקרה, המטופל משוחרר עוד באותו יום עם הוראות והמלצות להמשך הטיפול והגנה על אשור העקירה. אם מקפידים על הוראות הטיפול, תהליך ההתאוששות יהיה מהיר וקל. במידה ולא נוהגים כך, תהליך ההתאוששות עלול להתארך.